下一代基于邻近连接的检测如何推进空间蛋白质组学的

研究人员可以使用 Navinci 的基于邻近连接的创新空间蛋白质组学解决方案组合来可视化和量化蛋白质、它们的相互作用以及细胞和组织中的修饰。

蛋白质形成巨大、复杂的相互作用网络来介导细胞功能。它们的表达和结合是动态的，细胞响应内部和外部刺激而上调或下调蛋白质水平以及蛋白质复合物的组装和分解。蛋白质功能可以通过翻译后修饰 (PTM)、组织分布模式和亚细胞定位进一步完善。

蛋白质并不是孤立发挥作用的。大多数蛋白质功能是由蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 和 PTM 介导的。蛋白质相互作用组的一个节点的破坏可能会破坏整个网络的平衡。因此，阐明 PPI 是了解健康和疾病中的细胞信号传导途径以及识别新药物靶点的关键。  

为了充分了解蛋白质功能的复杂性，有必要在其天然环境中观察 PPI，然而，该领域的检测工具历来受到限制。使用免疫共沉淀、蛋白质印迹或 FRET/BRET 测定等技术无法获得蛋白质动态的空间视图，这些技术会破坏细胞和组织结构或天然蛋白质状态。此外，使用传统的免疫荧光 (IF) 和免疫组织化学 (IHC) 方法无法可靠地进行 PPI 研究，这些方法只能确定两个荧光标签是否出现共定位，这可能是分辨率限制的结果，而不是真正的结果。相互作用。

Naveni ®基于邻近连接的检测是下一代技术，可 通过检测和可视化改进蛋白质及其修饰的原位研究：

• 蛋白质-蛋白质相互作用
  

• 同时游离和相互作用的蛋白质
  

• 翻译后修饰（例如磷酸化）

• 蛋白质定位和分布

建立在遗产之上

开发原始邻近连接分析 (PLA) 的先驱者也构建了 Navinci 的平台。Navinci 的产品基于 Naveni ®邻近连接技术，这是一种基于邻近连接的方法，利用寡核苷酸设计和抗体-寡核苷酸缀合物的现代进步，在特异性、灵敏度、易用性和稳定性方面比现有空间蛋白质组学技术具有显着优势。数据解释。

优异的特异性

Naveni ®邻近连接技术使用一对精心挑选的 Navenibodies（与专有寡核苷酸臂缀合的抗体）来直接（即通过初级缀合物系统）或间接（即通过次级缀合物系统）检测感兴趣的靶标。仅当检测到的蛋白质距离为 40 nm 或更小时，Navanibody 对之间才会发生邻近连接，从而确保 PPI 检测。通过 Navenibody 对对靶标进行双重识别，通过减少抗体交叉反应性引起的非特异性结合来增强特异性。

高灵敏度

专有的 UnFold 检测系统可放大信号，与现有选项相比，可以实现高灵敏度和更高的信噪比。当发生邻近连接时，Navenibodies 上的寡核苷酸探针被激活并杂交以形成 DNA 环。添加聚合酶后，就会启动滚环扩增 (RCA) 反应，从而扩增环序列。这增强了信号强度，因为每个重复序列都可以通过单独的荧光团标记的检测寡核苷酸进行检测，从而导致数百个荧光标签标记单个 PPI。

清晰的目标检测和定量

这些信号可以作为不同的荧光或显色点进行检测，可以通过荧光或明场显微镜（取决于所选的试剂盒格式）进行可视化。使用数字图像分析或视觉解释可以轻松量化结果。

无需人工表达

由于 Naveni ®邻近连接技术，研究人员有望实现比传统 PLA 高达 10 倍的灵敏度提高，从而可以检测内源水平的低丰度蛋白质或难以检测的靶标，而无需实验过度表达，并且只需极少的投入使用珍贵（且昂贵）的抗体。

与现有的组织学工作流程和设备兼容

所有 Navinci 产品均与现有的组织学工作流程和标准组织学设备兼容。可选择明场显微镜和荧光显微镜，无需额外仪器。协议与核染料或组织学染色剂（如苏木精和伊红等）共染色兼容，可在保留的细胞或组织结构内提供目标 PPI 的可视化。