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用于靶向 DNA 和 RNA 测序的 CleanPlex 扩增子测序技术

更新时间:2024-03-08      点击次数:372

CleanPlex ®是一种超可扩展且超灵敏的NGS 扩增子测序技术。它具有高度先进的专有多重 PCR 引物设计算法、极其均匀的多重 PCR 扩增化学物质 和 创新的背景清洁化学物质。它们共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能够突破传统的基于扩增子和基于混合捕获的目标富集技术的限制。


功能亮点:

  • 超高的扩增均匀性和超低的PCR背景噪音(更准确的变异调用或更低的测序成本)

  • 单管 3 小时工作流程,手动操作时间最少(轻松自动化)

  • 兼容困难样品(降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA)和主要测序平台(Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq)

  • 高的灵敏度(低至单细胞水平直接扩增*)

  • 出色的面板大小可扩展性,单个多重 PCR 池中的扩增子数可达 20,000 多个

  • 检测和分析单核苷酸变异(SNV)、小插入和缺失(Indels)、拷贝数变异(CNV)、基因融合/剪接变异、基因表达水平、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)、内部串联复制(ITD)等

具体来说,扩增子测序技术提供了一种专注于特定基因或特定感兴趣基因组区域的靶向方法。
全基因组测序(WGS)及其相应的全基因组扩增(WGA)方法更适合研究和发现类型的应用,而靶向测序或靶向基因测序对于许多快速增长的临床和工业应用至关重要,这些应用的成本和速度都受到限制。更重要。

基因组学界面临的挑战之一是持续获取大量测序原始数据,这些数据尚未全成功地翻译和解释,以帮助在更广泛的范围内推进研究、诊断和治疗疾病。即使目前测序成本降低,全基因组测序方法实际上也只能用于基础研究、群体遗传学或罕见疾病检测等特定场景。有针对性的或有针对性的方法将更适合了解疾病进展并指导临床环境中的治疗选择或在工业应用中大规模筛查 DNA 样本。此外,就实验室操作和用于存储和处理大量数据的生物信息学基础设施而言,对整个基因组或外显子组进行测序可能非常昂贵。因此,靶向测序对于精准医疗和研究的持续进步变得至关重要。

cleanplex DNA 扩增子测序工作流程

图 2. CleanPlex DNA 靶标富集和文库制备工作流程

cleanplex RNA 靶标富集文库制备工作流程

图 3. CleanPlex RNA 靶标富集和文库制备工作流程































Paragon Genomics 总部位于旧金山湾区,是一家快速发展的精准医疗公司。我们的靶向测序技术CleanPlex® DNACleanPlex® RNA、CleanPlex® UMIOmniFusion™为精准肿瘤学、传染病检测、遗传性疾病检测、单细胞分析、分子育种和许多其他应用提供全面的解决方案。

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